Lineární reprezentace chemických struktur

  • J. Jirát CZ-OPENSCREEN: Národní infrastruktura pro chemickou biologii, Ústav molekulární genetiky AV ČR v.v.i., Praha | CZ-OPENSCREEN: Národní infrastruktura pro chemickou biologii, Laboratoř informatiky a chemie, Fakulta chemické technologie, Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, Praha
  • D. Svozil CZ-OPENSCREEN: Národní infrastruktura pro chemickou biologii, Ústav molekulární genetiky AV ČR v.v.i., Praha | CZ-OPENSCREEN: Národní infrastruktura pro chemickou biologii, Laboratoř informatiky a chemie, Fakulta chemické technologie, Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, Praha
Klíčová slova: lineární reprezentace, SMILES, InChI, InChIKey, SMARTS

Abstrakt

An overview and description of the most used linear structure representations and identifiers based on 2D representation of molecule structures (SMILES, InChI, InChIKey) is given. For each type the following is described: algorithm for their generation, notation, basic principles of stereochemistry encoding, suitability for data transfer of chemical structures and for use as unique identifier. Format SMARTS (description of substructures and generic atoms/groups/bonds) is also briefly introduced.

Publikované
2017-11-15
Sekce
Články